Aviso: Esta sección del artículo revela parte de la trama de la serie que tal vez no quieras saber.
Sasuke y Danzo son apuñalado por el ataque del otro, Danzo pensó que su Izanagi se activaría y evitaría el ataque mortal pero resulta que Sasuke usó un Genjutsu para hacerle pensar que el último Sharingan de su brazo estaba abierto pero en realidad ya se había cerrado. Luego de que Danzo recibió el ataque mortal, se queda sin su brazo derecho luego de que perdió el control sobre las células de Hashirama. Entonces activo el Sharingan de Shisui y tomó a Karin de rehén la cual estaba curando a Sasuke, pero a Sasuke no le importa la vida de su compañera y la atraviesa a ella y a Danzo con su Chidori Eisō. Danzo mal herido intentó escapar pero Tobi lo acorrala y le dice que tomará el ojo de Shisui. Danzo tiene un flashback donde se muestra su vida y su rivalidad con Hiruzen. Antes de morir Danzo intenta sellar a Sasuke y al supuesto Madara dentro de él con el Jutsu de Sellado de los Cuatro Simbolos Invertidos
En el anime cuando Tobi menciona el ojo de Shisui, Sasuke recuerda cuando fueron a ver a Itachi por la muerte de Shisui, pero en el manga no.
En la escena final, cuando Danzo habla sobre que jamás pudo alcanzar, a Hiruzen, se ve una escena donde Danzo persigue a Hiruzen, intentando alcanzarlo, y en el manga no.
Justo cuando Sasuke atraviesa a Danzo con su Chidori Eiso dice "Hermano...uno menos" se puede ver que Sasuke tiene activado su Mangekyo Sharingan solo en su ojo izquierdo, en el derecho lo tiene desactivado.