Distribución de misiones de acuerdo a un sistema de rangos desde A hasta D.
Para el mantenimiento de una aldea, es necesario que un ninja lleve a cabo misiones (任務, ninmu) de acuerdo la dificultad de la misión. Cuando el ninja realiza con éxito su misión, la aldea recibe un pago con la cual se sostiene económicamente. Estas misiones son clasificadas según su dificultad, de la siguiente forma:
- Rango S: Son misiones asignadas a jōnins poderosos, incluso, al propio Kage. Generalmente están dedicadas al asesinato o captura de ninjas que aparecen clasificados en el Libro Bingo (una especie de registro judicial en la serie) como criminales de alta peligrosidad por su destreza técnica y su afán de maldad.
- Rango A : Son misiones asignada a jōnins. Generalmente este tipo de misiones consiste en asesinar, espiar, capturar, a personas con cierto poder.
- Rango B: Son misiones asignadas a chūnins o superiores. Son consideradas misiones típicas de un ninja: Espionaje, Confusión, Recolección de Información, Asesinatos silenciosos.
- Rango C: Son misiones asignadas a chūnins y en algunos casos a Genin. Estas misiones son fáciles con un cierto grado de complejidad que, en casos extremos, puedan llevar al uso de técnicas ninja. Aquí se clasifican generalmente, misiones básicas que implican la salida de ninjas de su aldea oculta (en principio, ningún shinobi puede abandonar su Aldea sin autorización o justificación), tales como la protección de una persona u objeto cuando viajan de una aldea o de un país a otro, contra bandidos o forajidos sin mucha importancia o la captura de un criminal reputado.
- Rango D: Son misiones asignadas a genins, sobre todo si son recién graduados de la Academia Ninja. Son extremadamente fáciles, generalmente relacionadas con labores cotidianas o comunitarias como cortar el césped, colaborar con los oficios de granjas o fincas, pasear o recuperar mascotas, entre otros (y por ende, muy poco relacionadas con el arte ninja o el uso de técnicas ninja).